Jest absolwentką Zespołu Państwowych Szkół Muzycznych im. Kazimierza Wiłkomirskiego w Elblągu w klasie skrzypiec prof. Krystyny Jureckiej.
W czerwcu 2019 roku uzyskała z wyróżnieniem dyplom licencjata sztuki w Akademii Muzycznej w Gdańsku w klasie dr hab. Anny Wandtke-Wypych przy współpracy dr. hab. Andrzejem Kacprzakiem, prof. AM w Gdańsku.
W roku 2021 ukończyła z wyróżnieniem studia magisterskie na tejże uczelni (klasa dr hab. Anny Wandtke-Wypych). W październiku 2018 roku rozpoczęła studia na Universität fürMusik und Darstellende Kunst Wien.
Koncertuje w kraju i za granicą jako solistka, kameralistka oraz muzyk orkiestrowy. Jej grę cechuje niebywałe zaangażowanie, wirtuozeria połączona z dużą ekspresją oraz sceniczny temperament i widoczna pasja do muzyki.
Na jej koncie znajduje się wiele nagród, m.in. Grand Prix w IV Konkursie Polskiej Miniatury, I nagroda w konkursie na najlepsze wykonanie koncertu z orkiestrą SKO w Wiedniu, I nagroda w bałtyckim konkursie duetów, nagrody na międzynarodowych konkursach kameralnych w kwartecie oraz trio w Polsce, Szwecji oraz na Litwie.
Koncertowała w wielu miejscach w Polsce, m.in. w Filharmonii Krakowskiej, Filharmonii Lubelskiej, Studiu Polskiego Radia im. Witolda Lutosławskiego, Europejskim Centrum Muzyki Krzysztof Pendereckiego, Filharmonii Pomorskiej, Filharmonii Bałtyckiej, Sali Balowej Zamku w Łańcucie, Sali Balowej Pałacu w Wilanowie, Sali Balowej Pałacu w Bałoszycach. Od trzech lat koncertuje również w Austrii, gdzie podjęła studia u Josefa Hella – muzyka Wiener Philharmoniker. W minionym roku wystąpiła w słynnej Złotej Sali Wiedeńskiego Musikverein oraz w Grosser Saal Wiener Konzerthaus.
Małgorzata Wójcik ma na swoim koncie również występy solowe z towarzyszeniem orkiestr, są to m.in. SKO Orchester w Wiedniu, Orkiestra Filharmonii Lubelskiej, Elbląska Orkiestra Kameralna, Orkiestra ZPSM im. K. Wiłkomirskiego, polsko-niemiecka Sinfonietta czy Orkiestra Kameralna Akademii Muzycznej w Gdańsku.
Poza graniem solowym koncertuje w Kwartecie Edelweiss, którego jest prymariuszem w Wiedniu. Ponadto jest laureatką Stypendium Ministra Kultury i Dziedzictwa Narodowego, Stypendium Artystycznego Marszałka Województwa Warmińsko-Mazurskiego, Stypendium Artystycznego oraz Kulturalnego Prezydenta Miasta Elbląga, stypendium Lutosławski Youth Orchestra oraz Polskiej Orkiestry Młodzieżowej LYO, a także stypendium Rektora Akademii Muzycznej w Gdańsku dla najlepszych studentów.
W ostatnim czasie Małgorzata Wójcik nagrywa muzyczne video, naucza gry na skrzypach oraz wykonuje muzykę improwizowaną.